O Guarani de Palhoça comemora hoje 93 anos de história. Fundado em 15 de fevereiro de 1928, o Guarani tornou-se um clube profissional apenas a partir do ano 2000. Disputou o Campeonato Catarinense Série A em 2014 e em 2016.
O primeiro título do Guarani de Palhoça como clube profissional foi conquistado em 2003, quando o Bugre se sagrou campeão da então Segunda Divisão do Campeonato Catarinense.
Em 2004 disputou pela primeira vez a Primeira Divisão Estadual, terminando na 4ª colocação. Disputou a Série principal do futebol catarinense entre 2004 e 2008. Em 2013 retornou à elite após o bicampeonato do Catarinense Série B em 2012. Em 2014, apesar de não disputar a Série A do Catarinense, o Guarani representou o futebol catarinense no Campeonato Brasileiro da Série D.
Em 2015, o Bugre palhocense virou um clube empresa e, com o selo de Clube Formador, certificado pela CBF, é uma das equipes de Santa Catarina especializada em formar jogadores.
Parabéns Guarani, parabéns torcida palhocense!